Program Pascasarjana dirancang untuk menghasilkan magister dan doctor profesional di bidang Ilmu Program Studi Teologi dan Pendidikan Agama Kristen yang kreatif, inovatif, bertanggungjawab, memiliki spiritualitas yang tangguh dan mampu menjawab kebutuhan riil Gereja, Sekolah, Perguruan Tinggi dan Masyarakat.
Visi, misi dan tujuan program pascasarjana telah diupayakan penyebaran atau sosialisasinya, baik secara internal dengan membangun pemahaman sivitas akademika (dosen dan mahasiswa) dan tenaga kependidikan/ Staf di lingkungan STT Apollos Jakarta, maupun kepada pemangku kepentingan (stakeholder) lainnya serta masyarakat luas, melalui sarana publikasi baik media massa cetak (brosur, majalah, buku) maupun media eletronik (jaringan komputer Internet/ website, blogs, Facebook, email), maupun roadshow promosi, event-event seperti seminar, diskusi, studium general, dll. Sosialisasi internal dilakukan melalui pertemuan personalia struktural maupun fungsional organisasi manajemen serta sivitas akademika kampus, baik dalam rapat-rapat maupun pertemuan informal lainnya. Adapun sosialisasi eksternal ini terutama dilakukan oleh bagian administrasi umum dan para alumni.